Amethyst er þrískipt kristalkerfi, kristallinn er sexhyrndur súlulaga, sívalur yfirborðið er þverskipt, það eru vinstri lögun og hægri lögun, tvíkristal er mjög algeng.Hörkan er 7. Kristallinn inniheldur oft óreglulegar eða vængjuðar gas-vökva innfellingar.